普通新风系统由于回风等问题容易引发交叉污染，据此，医院引入新风系统时，将要更加考虑满足医院内空气品质及新风量的需要的同时，避免交叉感染等现象。尤其对于隔离病房，为了防止病人携带的病菌扩散到走廊及其他病房，造成其他人员的感染，医院新风系统会将隔离病房设置成相对于走廊为负压。在其卫生间设置排风，排风引入到医院新风机组；隔离病房排风利用负压局部排风单元处理后排出室外对于普通病房，也将其设置为负压。送、排风系统与隔离病房相似。

医院专用新风系统可以将进出空气的能量进行交换，调节室内温度。在夏季，室内空调开启，室外的热空气引入时进行能量交换，预冷交换之后送入室内;冬季，使用暖气，室外的冷空气引入进行预热交换之后送入室内。能量交换避免室内温度变化较大，使室温保持稳定。

是灰尘上的有害附着物，漂浮在空气中的灰尘里，附有许多肉眼看不到的。不仅造成粉尘污染影响环境洁净，还可能危害人体健康。新风净化系统可驱除居室、工作场所里的尘埃，在引入空气时就去除灰尘、杀灭，创造一个舒适的环境。

我国大多数医院都是建国后新建于80年代改、扩建的，即使有些医院已有一些先进设备，但空间规模和形式已不能适应新的医疗流程和设备的要求；同时由于医院空调通风系统的不合理设计、运行、维护；造成医院建筑在快速发展的过程中也出现了一系列的问题：人员过度集中、室内环境较差、系统运行不合理、能耗较高、交叉感染等。这些问题的存在已经严重影响到医院内部医患人员的健康和医院的可持续发展。随着2003年SARS的爆发和病态建筑综合症（Sick Building Syndrome，简称SBS）的加剧，人们已经认识到了医院室内空气环境的重要性，试图寻求有效的措施来改善室内环境。