旋流除砂器的工作的核心原理是离心沉降和密度差。
切向进入与旋流产生：当含有砂粒的流体在一定压力下，从设备侧面的进水管以切向方向进入圆筒形的分离腔后，流体不再直线前进，而是沿着腔壁开始作猛烈的旋转运动，形成一股高速旋转的涡流 。
离心力分离：在高速旋转产生的强大离心力作用下，密度较大的砂粒和水被分离开来。密度大的砂粒受到更大的离心力，被甩向腔体的内壁 。
沉降与排出：这些砂粒在撞击壁面后，失去动能，在自身重力作用下沿着锥形的腔壁向下沉降，最终汇集到底部的集砂斗中 。
净化与溢流：与此同时，失去了大部分固体颗粒、相对洁净的流体（水或钻井液）则在涡流中心形成一股向上的液流，通过顶部的溢流管排出设备，完成净化过程 。
简而言之，除砂器就像一个“离心分离机”，利用旋转的力量将“重”的杂质和“轻”的介质分开。